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碳源-玉米淀粉及其水解液是抗生素、氨基酸、核昔酸、酶制剂等发酵中常用的碳源。马铃薯、小麦、燕麦淀粉等用于有机酸、醇等生产中。液化淀粉可被微生物产生的胞外淀粉酶和糖化酶逐步分解成葡萄糖，被菌体吸收利用。 根据微生物利用碳源速度的快慢，可将碳源分为速效碳源（readily metabolized carbon source），如葡萄糖、燕糖；迟效碳源（gradually metabolized carbon source），如乳糖、淀粉。葡萄糖等易被菌体迅速利用的糖类对许多产物合成有反馈调节作用，应注意控制其浓度，或与被菌体缓慢利用的多糖组成混合碳源，有利于目标产物的合成。如青霉素发酵中，葡萄糖能阻過青霉素的合成，而乳糖对青霉素的合成几乎无阻過作用。如果采用成本较低的葡萄糖作为青霉素合成的碳源，需采用流加等控制方式。
碳源 提高碳氮比除了补充碳源，也可以从分母下手，减少氮源。使用优质饲料，添加乳酸菌等促进肠道消化，提高鱼虾蛋白利用率。合理投喂，避免产生剩料，造成浪费及水体污染。使用脱氮产品，系统反硝化作用能够将水体中的硝酸盐及亚硝酸盐转化成氮气，彻底脱离水体。 提高碳氮比的好处。鱼虾残饵，粪便，有机碎屑，浮游生物等形成生物絮团被鱼虾二次利用，氨氮亚硝酸盐控制在很低的水平，鱼虾生存环境明显改善。其次，水体菌藻平衡，提高了水体生物量及多样性，水体受高温下雨等恶劣天气影响小，水质稳定。不会产生蓝藻，甲藻及老绿水等现象。水体底部有机物大量减少，寄生虫病害发生的几率大大降低。
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