由于水下作业比陆上工作条件复杂，操作技术要求高，因而只有在特殊情况下才采用。
水下堵漏清基 ①建筑物基面的清理：当水生物或水垢、水锈较轻时，用竹刷、钢丝刷、刮刀、砍斧、凿子或风动砂轮等清理;较重时则用高速射流水清洗。②基坑清理：一般由潜水员辅以工具进行;当工作面或工作量大时，则先用挖掘机、挖泥船或气泵进行初步清理。
水下钻孔 当孔深及孔径较小或在竖直面上钻孔时，可用风动凿岩机钻孔，由潜水员在水下直接操作。当在闸坝上游进行帷幕补强灌浆或钻大孔径 孔时，一般采用设在船台或浮排组成的工作台上的回转钻机钻孔。20世纪60年代以来，欧洲、美洲一些 和日本广泛采用了双套管(其外套管用以固定钻孔位置，保护钻具免受流水冲击;内套管头部镶有环形钻头，可以钻透覆盖层达到基岩中)在深水域钻孔。
水库的砌石坝体往往在坝体内设有混凝土防渗墙。若防渗墙出现漏水，由于结构的原因，将无法针对漏点进行处理。除了拆除重建，只有在坝前加做防渗面板和对砌体进行灌浆堵漏。本文介绍一种灌浆堵漏的处理方法。
1） 漏水分析
上图的坝体漏水主要集中在新加高的坝体部分（锈斑是老坝体）。高水位时漏水集中在老坝顶从新加高坝墙中切除的钢架木管内以股状射流而出。低水位时老坝墙面只有浸湿。可见新筑墙体的砌石质量很差，砌石平缝竖缝砂浆不饱满造成。
2）水下堵漏措施：采用背坡水平孔和坝顶竖孔压力灌注水泥浆。
3) 施工要点
①在大坝背坡上部钻水平孔，可以搭设满面脚手架，也可以使用可移动的高空吊架。笔者设计的高空吊架经使用效果很好
②在作业顺序上，应该先做背坡的灌堵孔，因为若先灌竖孔会出现背坡漏浆，堵塞困难。
③由于石砌缝横竖交叉，为使浆液行走足够远，浆液浓度不宜太稠，比重在1.3~1.4之间为宜。
④灌压应根据灌点处的砌体高度进行控制，可以按每米厚加压0.06~0.1MPa进行估算。
⑤以浆液自下向上挤压质量保证较为可靠。
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